В функции sum вы проходите по каждой координате всего один раз (пока соответствующая переменная не станет равна 0), нужно восстановить значение переменных 2-го и 3-го циклов после их окончания на начальные.

Немного оффтопа. Трехмерный Фенвик это, конечно, хорошо, но на практике он мало где нужен. Не кажется ли Вам (учитывая ваш зеленый на текущий момент цвет) что нужно заниматься чем-нибудь другим? Научиться решать задачи А и B див1(в которых никогда не бывает трехмерного Фенвика, да и двумерного тоже)? Многомерные структуры обычно требуют в более тяжелых задачах — и в таких задачах вполне могут давать "в нагрузку" как подзадачи A и B див1.